pRESTO - The REpertoire Sequencing TOolkit

pRESTO是一个工具箱，用来处理淋巴细胞集高通量测序的原始reads。

高通量测序的巨大进步使得对免疫球蛋白集的大规模表征成为可能，该集合的定义为，在T和B淋巴细胞表面的跨膜抗原-受体蛋白的集合。REpertoire Sequencing TOolkit (pRESTO) 由一套工具组成，用以处理在比对到种系参考序列前的所有阶段的序列处理。pRESTO既可以处理单端测序reads，也可以处理双端测序reads。它包含一下特性：质量控制，引物掩盖，对嵌入序列条码的reads的注释，生成唯一分子识别码（unique molecular identifier (UMI) ）保守序列（#问题 原文是generation of unique molecular identifier (UMI) consensus sequences），双端测序reads的拼接和对重复序列的鉴别。同时也包含了大量的对序列进行排序，采样和转换操作的参数。